Rhizosphären-Amplikon-Analyse — Profilierung des Wurzelzonen-Mikrobioms

Die Rhizosphären-Amplikon-Analyse ist eine molekular-ökologische Pipeline zur Charakterisierung der mikrobiellen Gemeinschaften, die die wurzelnahe Boden-Zone – die Rhizosphäre – besiedeln, durch Sequenzierung gezielter Marker-Gene wie des bakteriellen 16S rRNA-Gens oder der pilzlichen ITS-Region. Sie wird häufig in der Agronomie, Bodenökologie und Pflanzenpathologie eingesetzt und ermöglicht es Forschern zu identifizieren, welche Mikroorganismen vorhanden sind, wie sich ihre Zusammensetzung unter verschiedenen Kulturen, Behandlungen oder Bodenbedingungen verschiebt und wie die Gemeinschaftsstruktur mit der Pflanzengesundheit und -produktivität zusammenhängt.