ScholarGate
Assistent
Process / pipelineSoil and plant microbiome ecology

Rhizosphere Amplicon Analyse — Profilering af Rodzonens Mikrobiom

Rhizosphere Amplicon Analyse er en molekylær-økologisk pipeline, der anvendes til at karakterisere de mikrobielle samfund, der bebor den rodnære jordzone — rhizosfæren — ved at sekventere målrettede markørgener såsom det bakterielle 16S rRNA-gen eller den fungale ITS-region. Metoden anvendes bredt inden for agronomi, jordøkologi og plantepatologi og gør det muligt for forskere at identificere, hvilke mikroorganismer der er til stede, hvordan deres sammensætning skifter under forskellige afgrøder, behandlinger eller jordbundsforhold, og hvordan samfundets struktur relaterer sig til planters sundhed og produktivitet.

Åbn i MethodMindSnartVideoSnartHent slides

Læs hele metoden

Kun for medlemmer

Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.

Log ind

Kilder

  1. Lundberg, D. S., Lebeis, S. L., Paredes, S. H., Yourstone, S., Gehring, J., Malfatti, S., ... & Dangl, J. L. (2012). Defining the core Arabidopsis thaliana root microbiome. Nature, 488(7409), 86-90. DOI: 10.1038/nature11237
  2. Berendsen, R. L., Pieterse, C. M., & Bakker, P. A. (2012). The rhizosphere microbiome and plant health. Trends in Plant Science, 17(8), 478-486. DOI: 10.1016/j.tplants.2012.04.001

Sådan citerer du denne side

ScholarGate. (2026, June 3). Rhizosphere Amplicon Sequencing and Community Profiling. ScholarGate. https://scholargate.app/da/agronomy/rhizosphere-amplicon-analysis

ScholarGateRhizosphere Amplicon Analysis (Rhizosphere Amplicon Sequencing and Community Profiling). Hentet 2026-06-15 fra https://scholargate.app/da/agronomy/rhizosphere-amplicon-analysis · Datasæt: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026