Analýza amplikonů rhizosféry — Profilování mikrobiomu kořenové zóny
Analýza amplikonů rhizosféry je molekulárně-ekologický postup používaný k charakterizaci mikrobiálních komunit obývajících půdní zónu přiléhající ke kořenům — rhizosféru — sekvenováním cílených markerových genů, jako je bakteriální gen 16S rRNA nebo ITS oblast hub. Tato metoda, široce používaná v agronomii, půdní ekologii a rostlinné patologii, umožňuje výzkumníkům identifikovat, které mikroorganismy jsou přítomny, jak se jejich složení mění v závislosti na různých plodinách, ošetřeních nebo půdních podmínkách a jak struktura komunity souvisí se zdravím a produktivitou rostlin.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Zdroje
- Lundberg, D. S., Lebeis, S. L., Paredes, S. H., Yourstone, S., Gehring, J., Malfatti, S., ... & Dangl, J. L. (2012). Defining the core Arabidopsis thaliana root microbiome. Nature, 488(7409), 86-90. DOI: 10.1038/nature11237 ↗
- Berendsen, R. L., Pieterse, C. M., & Bakker, P. A. (2012). The rhizosphere microbiome and plant health. Trends in Plant Science, 17(8), 478-486. DOI: 10.1016/j.tplants.2012.04.001 ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Rhizosphere Amplicon Sequencing and Community Profiling. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/agronomy/rhizosphere-amplicon-analysis
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →