রোগ প্রবণতার জেনেটিক ভিত্তি

রোগ প্রবণতার জেনেটিক ভিত্তি বলতে বোঝায় কীভাবে উত্তরাধিকারসূত্রে প্রাপ্ত ভিন্নতা ব্যক্তিদের সাধারণ রোগগুলির বিকাশের সম্ভাবনাকে বাড়িয়ে বা কমিয়ে দেয়, যা সরল মেন্ডেলীয় প্যাটার্ন অনুসরণ করে না। বেশিরভাগ সাধারণ অবস্থা — যেমন করোনারি রোগ, টাইপ ২ ডায়াবেটিস, এবং অনেক ক্যান্সার ও অটোইমিউন ডিসঅর্ডার — বহু-উপাদানযুক্ত, যা পরিবেশগত এবং জীবনযাত্রার প্রভাবগুলির সাথে অনেক জেনেটিক ভ্যারিয়েন্টের সম্মিলিত ছোট প্রভাব থেকে উদ্ভূত হয়। এটি একক-জিনগত ব্যাধিগুলির বিপরীত, যেখানে একটি একক মিউটেশন মূলত রোগের কারণ হয়।

Definition

জেনেটিক রোগ প্রবণতা হল বহু-উপাদানযুক্ত রোগের ঝুঁকির উত্তরাধিকারসূত্রে প্রাপ্ত উপাদান, যেখানে স্বতন্ত্রভাবে ছোট প্রভাবের অনেক জেনেটিক ভ্যারিয়েন্ট পরিবেশগত প্রভাবগুলির সাথে মিলিত হয়ে রোগ কখন এবং কীভাবে বিকশিত হয় তা প্রভাবিত করে, একটি একক জিন ফলাফল নির্ধারণের পরিবর্তে।

Scope

এই বিষয়টি সাধারণ রোগের বহু-উপাদানযুক্ত (পলিজেনিক) স্থাপত্য, সাধারণ এবং বিরল ভ্যারিয়েন্টের ভূমিকা, প্রধান আবিষ্কারের সরঞ্জাম হিসাবে জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডিজ (GWAS), বংশগততা এবং অনুপস্থিত বংশগততার ধারণা, এবং সামগ্রিক জেনেটিক প্রবণতাকে সংক্ষিপ্ত করার একটি উপায় হিসাবে পলিজেনিক রিস্ক স্কোর কভার করে। এটি একটি পদ্ধতিগত এবং ধারণাগত রেফারেন্স, ভবিষ্যদ্বাণীমূলক জেনেটিক টেস্টিং বা ব্যক্তিগত ঝুঁকি পরামর্শের ভিত্তি নয়।

Core questions

• কেন সাধারণ রোগগুলি মেন্ডেলীয় উত্তরাধিকারের পরিবর্তে একটি বহু-উপাদানযুক্ত, পলিজেনিক স্থাপত্য দেখায়?
• জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডিজ কীভাবে রোগের সাথে সম্পর্কিত ভ্যারিয়েন্টগুলি সনাক্ত করে এবং অ্যাসোসিয়েশন সংকেতগুলির যান্ত্রিক অর্থ কী?
• 'অনুপস্থিত বংশগততা' কী, এবং এর জন্য কী ব্যাখ্যা প্রস্তাব করা হয়েছে?
• পলিজেনিক রিস্ক স্কোরগুলি কীভাবে অনেক ছোট প্রভাবকে একত্রিত করে এবং তাদের সীমাবদ্ধতাগুলি কী?

Key concepts

• বহু-উপাদানযুক্ত (পলিজেনিক) উত্তরাধিকার
• সাধারণ ভ্যারিয়েন্ট, সাধারণ রোগ অনুমান
• জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি (GWAS)
• বংশগততা এবং অনুপস্থিত বংশগততা
• পলিজেনিক রিস্ক স্কোর
• জিন-পরিবেশ মিথস্ক্রিয়া
• লিংকেজ ডিসইকুইলিব্রিয়াম
• প্রভাবের আকার এবং অ্যালিল ফ্রিকোয়েন্সি

Mechanisms

সাধারণ রোগের প্রবণতা অনেক জেনেটিক ভ্যারিয়েন্টের সম্মিলিত ক্রিয়াকলাপকে প্রতিফলিত করে, যার বেশিরভাগই জনসংখ্যার মধ্যে সাধারণ এবং প্রতিটি ঝুঁকিকে সামান্যই পরিবর্তন করে, সাথে পরিবেশগত এবং আচরণগত কারণগুলিও জড়িত। জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডিজ (GWAS) লক্ষ লক্ষ ভ্যারিয়েন্ট পরীক্ষা করে অনেক ব্যক্তির মধ্যে পরিসংখ্যানগতভাবে রোগের সাথে সম্পর্কিত ভ্যারিয়েন্টগুলি খুঁজে বের করে, লিংকেজ ডিসইকুইলিব্রিয়াম ব্যবহার করে যাতে জেনোটাইপ করা মার্কারগুলি কাছাকাছি কার্যকারণ ভ্যারিয়েন্টগুলিকে ট্যাগ করে। সম্পর্কিত ভ্যারিয়েন্টগুলির সম্মিলিত প্রভাব একটি পলিজেনিক রিস্ক স্কোর হিসাবে প্রকাশ করা যেতে পারে। একটি ধারাবাহিক পর্যবেক্ষণ হল যে চিহ্নিত ভ্যারিয়েন্টগুলি পারিবারিক গবেষণা থেকে অনুমান করা বংশগততার কেবল একটি অংশ ব্যাখ্যা করে — 'অনুপস্থিত বংশগততা' — যা বিরল ভ্যারিয়েন্ট, কাঠামোগত ভিন্নতা, জিন-পরিবেশ মিথস্ক্রিয়া এবং বিস্তৃত 'ওমনিজেনিক' মডেলগুলির উপর কাজকে উৎসাহিত করেছে যেখানে মূলত সমস্ত প্রকাশিত জিন নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কের মাধ্যমে অবদান রাখে।

Clinical relevance

প্রবণতার স্থাপত্য বোঝালে স্পষ্ট হয় কেন বেশিরভাগ সাধারণ রোগ সরল উত্তরাধিকার ছাড়াই পরিবারগুলিতে একত্রিত হয় এবং প্যাথলজি ও এপিডেমিওলজিতে জেনেটিক-অ্যাসোসিয়েশন প্রমাণ কীভাবে ব্যাখ্যা করা হয় সে সম্পর্কে তথ্য দেয়। এই এন্ট্রিটি ধারণাগত এবং বর্ণনামূলক; এখানে আলোচিত পলিজেনিক স্কোর এবং অ্যাসোসিয়েশন ফলাফলগুলি ব্যক্তিগত ভবিষ্যদ্বাণী, স্ক্রিনিং বা ক্লিনিকাল সিদ্ধান্ত গ্রহণের জন্য উপস্থাপন করা হয়নি।

Epidemiology

জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডিজ (GWAS) বেশিরভাগ সাধারণ রোগের জন্য প্রচুর সংখ্যক ঝুঁকির লোকাস চিহ্নিত করেছে, তবুও স্বতন্ত্রভাবে এগুলি ছোট ঝুঁকির পরিবর্তন ঘটায়। যমজ এবং পারিবারিক গবেষণা থেকে বংশগততার অনুমানগুলি সাধারণত সাধারণ রোগের জন্য যথেষ্ট হয় এবং সেই বংশগততা এবং আবিষ্কৃত ভ্যারিয়েন্ট দ্বারা ব্যাখ্যা করা ভিন্নতার মধ্যে ব্যবধান অধ্যয়নের একটি সক্রিয় ক্ষেত্র হিসাবে রয়ে গেছে।

History

প্রাথমিক ক্যান্ডিডেট-জিন এবং লিংকেজ পদ্ধতিগুলি সাধারণ রোগের জন্য সীমিত সাফল্য পাওয়ার পর, মানব ভিন্নতার ক্যাটালগিং (হ্যাপম্যাপ এবং এসএনপি ম্যাপ) ২০০০-এর দশকের মাঝামাঝি থেকে জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডিজ (GWAS) সক্ষম করে, যা দ্রুত হাজার হাজার লোকাস চিহ্নিত করে। এইগুলি পারিবারিক-ভিত্তিক বংশগততার কেবল একটি অংশ ব্যাখ্যা করে এই স্বীকৃতি 'অনুপস্থিত বংশগততা' বিতর্ককে তৈরি করে এবং পরবর্তী পলিজেনিক এবং ওমনিজেনিক মডেলগুলি সাধারণ-রোগের স্থাপত্যকে জিনোম জুড়ে অত্যন্ত বিস্তৃত হিসাবে পুনর্গঠিত করে।

Debates

সাধারণ রোগের 'অনুপস্থিত বংশগততা' কী ব্যাখ্যা করে?

GWAS-শনাক্ত সাধারণ ভ্যারিয়েন্টগুলি পারিবারিক গবেষণা থেকে অনুমান করা বংশগততার কেবল একটি অংশ ব্যাখ্যা করে; প্রস্তাবিত ব্যাখ্যাগুলির মধ্যে রয়েছে অনেক অনাবিষ্কৃত ছোট-প্রভাবের ভ্যারিয়েন্ট, বৃহত্তর প্রভাবের বিরল ভ্যারিয়েন্ট, কাঠামোগত ভিন্নতা, জিন-পরিবেশ মিথস্ক্রিয়া এবং অতিরিক্ত অনুমান করা বংশগততা, যার কোনো একক সমাধান নেই।

সাধারণ রোগগুলি কি পলিজেনিক নাকি কার্যকরভাবে 'ওমনিজেনিক'?

সম্পর্কিত ভ্যারিয়েন্টগুলি জিনোমের বেশিরভাগ অংশে ছড়িয়ে আছে এমন প্রমাণ এই প্রস্তাবনার দিকে পরিচালিত করেছে যে একটি প্রাসঙ্গিক কোষের প্রকারে প্রকাশিত প্রায় সমস্ত জিন নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কের মাধ্যমে একটি বৈশিষ্ট্যে অবদান রাখে, যা পলিজেনিক মডেলকে প্রসারিত করে এবং অ্যাসোসিয়েশন থেকে প্রক্রিয়া কীভাবে অনুমান করা হয় তা পুনর্গঠিত করে।

Key figures

• Teri Manolio
• Peter Visscher
• Jonathan Pritchard

Seminal works

• manolio-2009-sus
• visscher-2017
• boyle-2017

Frequently asked questions

রোগ প্রবণতা জেনেটিক রোগ থেকে কীভাবে আলাদা?

একটি জেনেটিক রোগ যেমন একটি একক-জিনগত ব্যাধি মূলত একটি নির্দিষ্ট মিউটেশন দ্বারা সৃষ্ট হয়, যেখানে রোগ প্রবণতা উত্তরাধিকারসূত্রে প্রাপ্ত ভিন্নতাকে বোঝায় যা কেবল একটি সাধারণ, বহু-উপাদানযুক্ত রোগ বিকাশের সম্ভাবনাকে বাড়ায় বা কমায়, যেখানে পরিবেশ এবং সুযোগও প্রধান ভূমিকা পালন করে।

একটি জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি (GWAS) আসলে কী খুঁজে পায়?

এটি এমন জেনেটিক ভ্যারিয়েন্টগুলি খুঁজে পায় যা বৃহৎ জনসংখ্যার মধ্যে রোগবিহীন ব্যক্তিদের তুলনায় রোগাক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে বেশি দেখা যায়, যা ঝুঁকির সাথে পরিসংখ্যানগতভাবে সংযুক্ত জিনোমের অঞ্চলগুলিকে চিহ্নিত করে; এই ধরনের অ্যাসোসিয়েশনগুলি জড়িত থাকার ইঙ্গিত দেয় তবে নিজেরাই প্রমাণ করে না যে একটি নির্দিষ্ট ভ্যারিয়েন্ট রোগের কারণ।