Process / pipelineEpigenomics

ATAC-seq বিশ্লেষণ

ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) হলো জিনোম-ব্যাপী ক্রোমাটিন অভিগম্যতা (chromatin accessibility) প্রোফাইল করার একটি পদ্ধতি। ২০১৩ সালে Buenrostro এবং সহকর্মীদের দ্বারা উদ্ভাবিত, ATAC-seq অতি-সক্রিয় ট্রান্সপোজ (transposase) ব্যবহার করে উন্মুক্ত, অভিগম্য ক্রোমাটিন অঞ্চলগুলিকে চিহ্নিত করে, যা নিয়ন্ত্রক ডিএনএ উপাদানগুলির (regulatory DNA elements) দ্রুত এবং সংবেদনশীল শনাক্তকরণ সক্ষম করে। ATAC-seq জিন নিয়ন্ত্রক ল্যান্ডস্কেপ (gene regulatory landscapes) চিহ্নিতকরণ, কোষ-নির্দিষ্ট নিয়ন্ত্রক উপাদান আবিষ্কার এবং জিন নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্ক (gene regulatory networks) অনুমান করার জন্য একটি আদর্শ কৌশলে পরিণত হয়েছে।

MethodMind-এ খুলুনশীঘ্রইভিডিওশীঘ্রইDownload slides

পুরো পদ্ধতিটি পড়ুন

শুধু সদস্যদের জন্য

এই অংশটি পড়তে বিনামূল্যের অ্যাকাউন্ট দিয়ে সাইন ইন করুন।

সাইন ইন করুন

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

উৎস

  1. Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link
  2. Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646
  3. Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link

এই পৃষ্ঠা কীভাবে উদ্ধৃত করবেন

ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/bn/genetics/atac-seq-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

যেখানে উদ্ধৃত

ScholarGateATAC-seq Analysis (ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes). 2026-06-15 তারিখে সংগৃহীত, উৎস: https://scholargate.app/bn/genetics/atac-seq-analysis · ডেটাসেট: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026