ডি নভো ট্রান্সক্রিপ্টোম অ্যাসেম্বলি
ডি নভো ট্রান্সক্রিপ্টোম অ্যাসেম্বলি রেফারেন্স জিনোমের প্রয়োজন ছাড়াই সরাসরি সিকোয়েন্সিং রিড থেকে পূর্ণ দৈর্ঘ্যের মেসেঞ্জার আরএনএ সিকোয়েন্স পুনর্গঠন করে। রেগেভ, হাস এবং সহকর্মীদের দ্বারা উদ্ভাবিত এই পদ্ধতিটি নন-মডেল জীবগুলিতে ট্রান্সক্রিপ্ট আবিষ্কার এবং নতুন আইসোফর্ম, ফিউশন জিন এবং স্প্লাইস ভ্যারিয়েন্ট সনাক্তকরণ সক্ষম করে।
পুরো পদ্ধতিটি পড়ুন
এই অংশটি পড়তে বিনামূল্যের অ্যাকাউন্ট দিয়ে সাইন ইন করুন।
পদ্ধতি-মানচিত্র
সম্পর্কিত পদ্ধতিসমূহের প্রতিবেশ — অন্বেষণ করতে একটি নোড নির্বাচন করুন।
উৎস
- Grabherr, M. G., Haas, B. J., Yassour, M., Levin, J. Z., Thompson, D. A., Amit, I., ... & Regev, A. (2011). Full-length transcriptome assembly from RNA-Seq data without a reference genome. Nature Biotechnology, 29(7), 644-652. DOI: 10.1038/nbt.1883 ↗
- Haas, B. J., Papanicolaou, A., Yassour, M., Grabherr, M., Blood, P. D., Bowden, J., ... & Regev, A. (2013). De novo transcript sequence reconstruction from RNA-seq using the Trinity platform for reference generation and analysis. Nature Protocols, 8(8), 1494-1512. DOI: 10.1038/nprot.2013.084 ↗
- Pertea, M., Pertea, G. M., Antonescu, C. M., Chang, T. C., Mendell, J. T., & Salzberg, S. L. (2015). StringTie enables improved assembly of novel transcripts from RNA-seq data. Nature Biotechnology, 33(3), 290-295. link ↗
এই পৃষ্ঠা কীভাবে উদ্ধৃত করবেন
ScholarGate. (2026, June 3). De Novo RNA-Seq Transcriptome Assembly. ScholarGate. https://scholargate.app/bn/bioinformatics/de-novo-transcriptome-assembly
কোন পদ্ধতি?
এই পদ্ধতিটিকে তার নিকটতম সমগোত্রীয়দের পাশে রাখুন এবং পাশাপাশি পড়ুন — গ্রন্থাগার বইগুলি টেবিলে সাজিয়ে দেয়; নির্বাচন আপনার।
- CRISPR স্ক্রিন বিশ্লেষণজৈব তথ্যবিজ্ঞান↔ তুলনা করুন
- HMMER প্রোফাইল অনুসন্ধানজৈব তথ্যবিজ্ঞান↔ তুলনা করুন
- মেটাজেনোমিক বিনিংজৈব তথ্যবিজ্ঞান↔ তুলনা করুন
যেখানে উদ্ধৃত
এই পৃষ্ঠায় কোনো ত্রুটি চোখে পড়েছে? জানান বা সংশোধনের প্রস্তাব দিন →