Тест на ХКА
Тестът на Хъдсън-Крейтман-Агуаде (ХКА) е статистически метод, който проверява за неутрална еволюция чрез сравняване на нивата на полиморфизъм в рамките на популациите и дивергенцията между популациите при множество локуси. Разработен от Хъдсън, Крейтман и Агуаде през 1987 г., този тест използва принципа, че неутралните локуси трябва да показват очаквани връзки между полиморфизма и дивергенцията. Локуси, отклоняващи се от тези връзки, са кандидати за селекция. Тестът ХКА е особено полезен за откриване на селекция при геномни проучвания, тъй като използва относителни сравнения между локуси, вместо да изисква външна калибрация.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Източници
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/genetics/hka-test
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Коалесцентна теорияГенетика↔ compare
- F-статистики (FST)Генетика↔ compare
- Тестът на McDonald-Kreitman (MK)Генетика↔ compare
- Селективен суип (D на Таджима)Генетика↔ compare
Цитиран в
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →