RNA Velocity
RNA velocity is a computational method that infers the future developmental state of individual cells from single-cell RNA-sequencing data. Developed by La Manno and colleagues in 2018, RNA velocity analysis measures the direction and pace of cell state transitions by analyzing the ratio of unspliced to spliced mRNA transcripts within individual cells. This enables prediction of cell trajectories and differentiation pathways without requiring temporal sampling or manipulation, providing unique insights into cell fate decisions during development and disease.
Înregistrare sursă
Citările sunt copiate integral din înregistrarea sursă a metodei. Nu se inferă nicio verificare la nivel de afirmație din acestea.
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. · DOI 10.1038/s41586-018-0414-6
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. · DOI 10.1038/s41587-020-0591-3
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. · URL
Afirmații curate
Afirmațiile sunt stocate în registrul dovezilor, fiecare cu propria evaluare.
Această vizualizare nu inventează o evaluare a afirmației dacă registrul nu conține una.
Metode conexe
Generate din graful metodelor și afișate ca relații sugerate automat — nu se inferă nicio afirmație de dovadă.