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CRISPR Screen Analysis/Evidência
Registro de evidência do método

CRISPR Screen Analysis

CRISPR screen analysis processes data from pooled genetic screens using CRISPR-Cas9 to identify genes required for cell growth, survival, or phenotype in specific conditions. Developed by Zhang, Sanjana, and others, this computational pipeline transforms sequencing readouts of guide RNA abundances into ranked lists of functional genes.

Sources recorded, not reviewed

Registro de origem

Citações copiadas literalmente do registro de origem do método. Nenhuma verificação em nível de alegação é inferida delas.

CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification
Registro de método taxonômico · process-pipeline / bioinformatics
  • Shalem, O., Sanjana, N. E., Hartenian, E., Shi, X., Scott, D. A., Mikkelsen, T. S., ... & Zhang, F. (2014). Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science, 343(6166), 84-87. · DOI 10.1126/science.1247005
  • Hart, T., Chandrashekhar, M., Aregger, M., Steinhart, Z., Brown, K. R., MacLeod, G., ... & Moffat, J. (2015). High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and pathways. Molecular Systems Biology, 11(8), 820. · URL
  • King, J. B., Palmer, A. C., & Sorger, P. K. (2020). Application of a genetic algorithm designed for flexible objective optimization in pharmaceutical research and development. Cancer Research, 79(13 Supplement), 3435. · URL
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Alegações curadas

Alegações persistidas no livro-razão de evidências, cada uma com sua própria avaliação.

Ainda não há alegações curadas

Esta visualização não inventa uma avaliação de alegação quando o livro-razão não a possui.

Métodos relacionados

Gerado a partir do grafo de métodos e mostrado como relações sugeridas por máquina — nenhuma alegação de evidência é inferida.

Same method familyDe Novo Transcriptome Assemblymachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Same method familyHMMER Profile Searchmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Same method familyMetagenomic Binningmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

Status da evidência

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Fontes

3 citações registradas, copiadas do registro de origem do método.

Ações

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