Time-series variant calling
Time-series variant calling is a bioinformatics pipeline that identifies and tracks genomic variants — typically somatic mutations — across multiple sequencing samples collected from the same subject at different time points. It is most widely applied in cancer genomics to reconstruct tumour evolution, monitor minimal residual disease, and detect the emergence of therapy-resistant clones. By jointly modelling variant allele frequencies across the temporal dimension, the method distinguishes true somatic changes from sequencing noise and estimates clonal dynamics over time.
Εγγραφή πηγής
Οι παραπομπές αντιγράφονται αυτούσιες από την εγγραφή πηγής της μεθόδου. Δεν υπονοείται επαλήθευση σε επίπεδο ισχυρισμού από αυτές.
- Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. · URL
- McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. · URL
Επιμελημένοι ισχυρισμοί
Οι ισχυρισμοί έχουν αποθηκευτεί στο καθολικό τεκμηρίων, καθένας με τη δική του αξιολόγηση.
Αυτή η προβολή δεν επινοεί αξιολόγηση ισχυρισμού όταν το καθολικό δεν έχει κανέναν.
Σχετικές μέθοδοι
Δημιουργούνται από τον γράφο μεθόδων και εμφανίζονται ως προτεινόμενες από μηχανή σχέσεις — δεν υπονοείται ισχυρισμός τεκμηρίου.